Emacs, tramp: File ... is read-only on disk. Change buffer mode?

Это сообщение может появиться, если соединение разорвалось и tramp не может установить повторное соединение самостоятельно.

Решение:

M-x tramp-cleanup-all-connections

Затем можно обновить буфер в dired или повторно сохранить файл.